RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CYB5R2Q6BCY4 276 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PLBD1Q6P4A8 553 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 COLCA1Q6ZS62 124 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10S1Q8NGN2 331 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MSL2Q9HCI7 577 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PTTG3PQ9NZH4 202 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZANQ9Y493 2812 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 INAFM1C9JVW0 142 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC14BO60729 498 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF23P17027 643 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYBB2P43320 205 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TPTEP56180 551 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM209AQ5JX71 171 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXW12Q6X9E4 464 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CPOQ8IVL8 374 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP8Q8N3A8 854 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SPTSSAQ969W0 71 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 YAE1D1Q9NRH1 226 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPMQ9NSP4 180 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TVP23BQ9NYZ1 205 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP5LA4QPB2 252 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 LILRA1O75019 489 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 MITFO75030 526 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 LCATP04180 440 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ADH4P08319 380 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TACSTD2P09758 323 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV4-31P0DP07 118 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTR3P61158 418 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ESRRGP62508 458 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R2BQ00005 443 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK5R2Q13319 367 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAPC1Q16533 368 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PYDC1Q8WXC3 89 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SLAMF6Q96DU3 332 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 DIRC2Q96SL1 478 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 INTS14Q96SY0 518 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SAP30LQ9HAJ7 183 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT84Q9NSB2 600 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R135 149 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 RP2O75695 350 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CHN2P52757 468 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF13Q15543 124 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIP10Q15642 601 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL12Q53G59 568 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMAT1Q5H9K5 638 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM4DQ6B0I6 523 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2T2Q6IF00 324 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 USP51Q70EK9 711 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 DPY19L4Q7Z388 723 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF799Q96GE5 643 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 EGLN1Q9GZT9 426 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 MARCH7Q9H992 704 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 NF1P21359 2839 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIHO43447 177 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 GZMKP49863 264 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZR03 302 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SHFQ7M4L6 423 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TIGD4Q8IY51 512 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5AS1Q8N127 324 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6N2Q8NGY6 317 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ST7LQ8TDW4 575 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 POM121Q96HA1 1249 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNJ15Q99712 375 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 COPS4Q9BT78 406 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CD55P08174 381 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC6A9P48067 706 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 MALLQ13021 153 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 HFEQ30201 348 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SPRNQ5BIV9 151 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf52Q5T4I8 152 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATC1Q76KD6 591 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 BBS1Q8NFJ9 593 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2Z1Q8NG97 314 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ELMOD3Q96FG2 381 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ABHD6Q9BV23 337 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 TREM2Q9NZC2 230 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNG2Q9Y698 323 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms