RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PSG4Q00888 419 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TGM3Q08188 693 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MORF4L2Q15014 288 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF767PQ75MW2 155 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DHDDSQ86SQ9 333 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CERS3Q8IU89 383 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 Q8NAQ8 132 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR4D6Q8NGJ1 314 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR4D5Q8NGN0 318 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAIP1Q8WWC4 291 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GHSRQ92847 366 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM186Q96B77 213 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C7orf34Q96L11 122 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IKZF2Q9UKS7 526 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NPTNQ9Y639 398 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TNCP24821 2201 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PXDNLA1KZ92 1463 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SYCE3A1L190 88 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IZUMO1RA6ND01 250 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRIM64A6NGJ6 449 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRIM64BA6NI03 449 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KNCNA6PVL3 124 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MED7O43513 233 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR7A10O76100 309 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAGEA12P43365 314 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR12D2P58182 307 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DGCR6Q14129 220 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF77Q15935 545 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DGUOKQ16854 277 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KCTD21Q4G0X4 260 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CDH26Q8IXH8 852 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C10orf53Q8N6V4 93 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KRT35Q92764 455 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAD51AP1Q96B01 352 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CNDP1Q96KN2 507 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TTC25Q96NG3 672 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 XKR8Q9H6D3 395 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MGAT4BQ9UQ53 548 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C22orf24Q9Y442 160 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LRRC42Q9Y546 428 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A1B0GU33 70 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A1B0GVL5 298 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC31A1O15431 190 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGHV3-53P01767 116 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC1A2P43004 574 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ARF5P84085 180 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C9orf135Q5VTT2 229 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PYHIN1Q6K0P9 492 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LIX1Q8N485 282 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C11orf72Q8NBR9 251 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR8K1Q8NGG5 319 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NUP205Q92621 2012 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FXYD5Q96DB9 178 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRIB3Q96RU7 358 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM243Q9BU79 118 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPZ1Q9BXG8 430 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ELOVL3Q9HB03 270 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAB18Q9NP72 206 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 INIPQ9NRY2 104 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC22A7Q9Y694 548 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KCPQ6ZWJ8 1503 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PLPP1O14494 284 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CLDN3O15551 220 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRKAB2O43741 272 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FCMRO60667 390 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SCO1O75880 301 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR5AC1P0C628 307 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ACADVLP49748 655 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ACTG2P63267 376 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms