RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 HCCSP53701 268 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 TPTEP56180 551 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 CLEC12BQ2HXU8 276 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 OTOSQ8NHW6 89 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF799Q96GE5 643 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB1BQ9H0U4 201 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 E9PQ18 207 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 THEM6Q8WUY1 208 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 MS4A5Q9H3V2 200 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 PTTG3PQ9NZH4 202 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM64A6NGJ6 449 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM64BA6NI03 449 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LCATP04180 440 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LYNP07948 512 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PEX2P28328 305 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC6A9P48067 706 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PRKXP51817 358 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PSG7Q13046 419 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC16A9Q7RTY1 509 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GID4Q8IVV7 300 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF525Q8N782 197 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 COG8Q96MW5 612 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNJ15Q99712 375 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR160Q9UJ42 338 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 F8P00451 2351 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A31A6NKX4 558 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 H3BSA7 217 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 J3QW42 95 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBG1P23258 451 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CMBLQ96DG6 245 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ANOS1P23352 680 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GGTLC2Q14390 218 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SNX33Q8WV41 574 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC2A1P11166 492 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 OPRL1P41146 370 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC15A1P46059 708 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GRB2P62993 217 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MOGQ16653 247 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DRAM2Q6UX65 266 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DLGAP1O14490 977 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 H2BFMP0C1H6 154 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ALOX5APP20292 161 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 HSD11B1P28845 292 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MMP15P51511 669 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TNK1Q13470 666 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SNAI3Q3KNW1 292 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 HAVCR1Q96D42 359 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TMUB1Q9BVT8 246 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ADGRL4Q9HBW9 690 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM118AQ9NWS6 357 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 AASSQ9UDR5 926 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ACANP16112 2415 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PLSCR5A0PG75 271 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 C5orf63A6NC05 138 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 C17orf100A8MU93 164 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CD99P14209 185 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 HTR1FP30939 366 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CX3CR1P49238 355 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS12P56730 875 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CLEC2AQ6UVW9 174 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXW12Q6X9E4 464 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-202ENST00000410062 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms