RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 PPIAL4FP0DN26 164 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2T2Q6IF00 324 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 CFAP77Q6ZQR2 320 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 LINC00346Q8IVM7 164 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 OR5AS1Q8N127 324 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 KLHL36Q8N4N3 616 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 OR9Q2Q8NGE9 314 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 NSL1Q96IY1 281 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 PCDHB10Q9UN67 800 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 IQCF6A8MYZ5 107 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 BHLHE40O14503 412 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 AVPP01185 164 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 SBK2P0C263 348 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 SELEP16581 610 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 GGT2P36268 569 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 BTG1P62324 171 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 LCN8Q6JVE9 175 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 C1QL2Q7Z5L3 287 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 ATG16L2Q8NAA4 619 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 OR4C15Q8NGM1 316 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 ZFAND2BQ8WV99 257 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 HCAR1Q9BXC0 346 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 FN3KQ9H479 309 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 LOC105371242A0A075B767 164 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 TCRBV5S2A0A599 114 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 CCNB2O95067 398 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 ACSM4P0C7M7 580 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 DHFR2Q86XF0 187 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2T4Q8NH00 348 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 SIGLEC11Q96RL6 698 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 DDOQ99489 341 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC30A2Q9BRI3 323 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 GCM1Q9NP62 436 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-203ENST00000407117 F5H5K5 113 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF823P16415 610 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 EPHA1P21709 976 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 SRP9P49458 86 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 LCN2P80188 198 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 USP43Q70EL4 1123 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 NANPQ8TBE9 248 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 DYSFO75923 2080 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A1B0GWJ7 208 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM178BH3BS89 294 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 GASTP01350 101 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 CALB2P22676 271 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 MMP16P51512 607 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 TPTEP56180 551 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 MALLQ13021 153 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 ZMYND11Q15326 602 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 PROKR2Q8NFJ6 384 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 OR10AD1Q8NGE0 317 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 MEGF10Q96KG7 1140 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 C7orf69Q9H7B7 122 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 BAIAP2Q9UQB8 552 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 ANK2Q01484 3957 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 VENTXO95231 258 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM107AO95990 144 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 CPT2P23786 658 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 MDH2P40926 338 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 LNX2Q8N448 690 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 CYB561A3Q8NBI2 242 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 AQP11Q8NBQ7 271 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 REEP1Q9H902 201 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 TBC1D23Q9NUY8 699 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 LCATP04180 440 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF181Q2M3W8 571 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2T5Q6IEZ7 315 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 BHLHE23Q8NDY6 225 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 OR8D4Q8NGM9 314 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2T29Q8NH02 315 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 SPTSSAQ969W0 71 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 MAP6Q96JE9 813 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 DGCR6LQ9BY27 220 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 WDR76Q9H967 626 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-203ENST00000407117 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms