RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 TTRP02766 147 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 TIMP3P35625 211 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 PMPCAQ10713 525 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 RAB35Q15286 201 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 TRAM1Q15629 374 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 STK11Q15831 433 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 YIF1BQ5BJH7 314 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 Q6ZT83 130 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 ZNF283Q8N7M2 679 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 COQ7Q99807 217 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 PBOV1Q9GZY1 135 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 POLEQ07864 2286 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PR80 420 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 GALP22466 123 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 GRB2P62993 217 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 SCRN3Q0VDG4 424 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 BCL2L15Q5TBC7 163 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 NR2C2APQ86WQ0 139 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 KCNJ15Q99712 375 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 SOX7Q9BT81 388 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 KCNN2Q9H2S1 579 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 SLC24A3Q9HC58 644 aa17.59■□□□□ 0.41
ODC1-202ENST00000405333 OR6C6A6NF89 314 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ZNF879B4DU55 563 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 P2RY10O00398 339 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 LMX1BO60663 402 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 OCM2P0CE71 109 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CD79AP11912 226 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CRYGSP22914 178 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 DCTDP32321 178 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 SLC6A9P48067 706 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD16Q6P6B7 361 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 FAM57BQ71RH2 274 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 GABRG1Q8N1C3 465 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 OR1F12Q8NHA8 337 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 RNF121Q9H920 327 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 NOX4Q9NPH5 578 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 PROCRQ9UNN8 238 aa17.58■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 EDN3P14138 238 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 HTR5AP47898 357 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 PCBD1P61457 104 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 OR8B12Q8NGG6 310 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 DERL3Q96Q80 235 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 SERPINA3P01011 423 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CCL2P13500 99 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CTSSP25774 331 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CACNA1BQ00975 2339 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 LSAMPQ13449 338 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 TBRG1Q3YBR2 411 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 SLC36A2Q495M3 483 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ELMOD2Q8IZ81 293 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 NIPAL2Q9H841 368 aa17.57■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 MYO7BQ6PIF6 2116 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 M0R135 149 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ERVH48-1M5A8F1 160 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CASKO14936 926 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 UCHL1P09936 223 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ACSM4P0C7M7 580 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 APEX1P27695 318 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 GFOD2Q3B7J2 385 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 Q499Y3 187 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 OR51E1Q8TCB6 317 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ZNF799Q96GE5 643 aa17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 A0A0G2JNJ9 132 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 IL1AP01583 271 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 OR10A3P58181 314 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 RAB1AP62820 205 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 DGUOKQ16854 277 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 SNAI3Q3KNW1 292 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ZNF584Q8IVC4 421 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 GPR148Q8TDV2 347 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 TMEM106AQ96A25 262 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A46Q96AG3 418 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 SLC17A5Q9NRA2 495 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 Q9UFV3 132 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 LOC100509620A0A075B734 347 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 A6NIN4 97 aa17.55■□□□□ 0.4
ODC1-202ENST00000405333 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms