RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF260Q3ZCT1 412 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 DCAF12L2Q5VW00 463 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ACBD4Q8NC06 268 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR2M3Q8NG83 312 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR10S1Q8NGN2 331 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC20Q8TCA0 184 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 SPSB2Q99619 263 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 FXYD6Q9H0Q3 95 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC2A8Q9NY64 477 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 PGA4P0DJD7 388 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 PGA3P0DJD8 388 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB3AP20336 220 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 GSK3AP49840 483 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 CLDN6P56747 220 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF529Q6P280 563 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR1J2Q8NGS2 313 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 PRRT1Q99946 306 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 NUP50Q9UKX7 468 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1W2PQM1 296 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM235A6NFC5 223 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF878C9JN71 531 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB27BO00194 218 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 MEN1O00255 615 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR2J2O76002 312 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 CALCRP30988 508 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 P2RY4P51582 365 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 MED9Q9NWA0 146 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 QRFPP83859 136 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR52N4Q8NGI2 321 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 OR6X1Q8NH79 312 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-202ENST00000399409 RFPL4AA6NLU0 287 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 RPA2P15927 270 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 LPCAT3Q6P1A2 487 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 TMED4Q7Z7H5 227 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 FJX1Q86VR8 437 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SCARB1Q8WTV0 552 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 OXGR1Q96P68 337 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 DHRS9Q9BPW9 319 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 ARL6Q9H0F7 186 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF28P17035 718 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 NKD1Q969G9 470 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC6A7Q99884 636 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 U3KQA8 63 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF20P17024 532 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 ADH6P28332 368 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNMB1Q16558 191 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 CDNFQ49AH0 187 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 CFAP77Q6ZQR2 320 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 OR5B2Q96R09 309 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 RDH8Q9NYR8 311 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1B0GTI1 187 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 DKK1O94907 266 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 FGL1Q08830 312 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 UNC119Q13432 240 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 TAF13Q15543 124 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 GSG1LQ6UXU4 331 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 STEAP2Q8NFT2 490 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-202ENST00000399409 OR13C8Q8NGS7 320 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms