RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 BEX2Q9BXY8 128 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A4Q9H015 551 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 STAB1Q9NY15 2570 aa7.24□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 F5H5K5 113 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PRODHO43272 600 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SPRY3O43610 288 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CIB2O75838 187 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 GLCEO94923 617 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SOX14O95416 240 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV1-46P01743 117 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LCATP04180 440 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ACSM4P0C7M7 580 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM157CP0CG43 387 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LYNX1P0DP58 116 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SPI1P17947 270 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FASP25445 335 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 POU1F1P28069 291 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PYCR1P32322 319 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 THBS2P35442 1172 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CDH15P55291 814 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ESRRGP62508 458 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CRMP1Q14194 572 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 GINS1Q14691 196 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TAF13Q15543 124 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CORO6Q6QEF8 472 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 DRAM2Q6UX65 266 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PARP8Q8N3A8 854 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8G5Q8NG78 346 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC7A6Q92536 515 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 YIPF5Q969M3 257 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ITFG2Q969R8 447 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB39BQ96DA2 213 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TOR3AQ9H497 397 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OPA3Q9H6K4 179 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MARCH7Q9H992 704 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 IL19Q9UHD0 177 aa7.23□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF878C9JN71 531 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 M0R135 149 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC14BO60729 498 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 GPANK1O95872 356 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 DBHP09172 617 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 GSTT1P30711 240 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CDK5Q00535 292 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SCGB2A2Q13296 93 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6AP1Q15904 470 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SNCBQ16143 134 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 FAHD1Q6P587 224 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 KLBQ86Z14 1044 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SPERTQ8NA61 448 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL17Q92583 94 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ERGIC1Q969X5 290 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF799Q96GE5 643 aa7.22□□□□□ -1.25
MT-TS1-201ENST00000387416 MAP6Q96JE9 813 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms