RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXW12Q6X9E4 464 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZTK2 550 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR86Q86TI4 376 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM216BQ8N7L0 139 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q8TCH9 128 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIFOQ8TCI5 191 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ST8SIA4Q92187 359 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 R3HDM4Q96D70 268 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITCHQ96J02 903 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR5M11Q96RB7 305 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB18Q99592 522 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ECSITQ9BQ95 431 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TXNIPQ9H3M7 391 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELOVL7A1L3X0 281 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAPPC13A5PLN9 417 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 M0QX08 132 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 LGALS8O00214 317 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCTN6O00399 190 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 SGCEO43556 437 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNNO75324 88 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXO24O75426 580 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 MT-ND1P03886 318 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBP1P09467 338 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAC2P15153 192 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 FPR3P25089 353 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TGFBR2P37173 567 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 BMXP51813 675 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTPNP58546 118 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 BPIFB3P59826 476 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERVFRD-1P60508 538 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPL27P61353 136 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSNK2BP67870 215 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR8B8Q15620 311 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDONQ4KMG0 1287 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLA1AQ53H76 456 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CORO6Q6QEF8 472 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTP4A1Q93096 173 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 RASD2Q96D21 266 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCL13Q99616 98 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 B9D2Q9BPU9 175 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 EBF4Q9BQW3 602 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM38AQ9H6F2 299 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 SORL1Q92673 2214 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 MEIOCA2RUB1 952 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM247A6NEH6 219 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 OOEPA6NGQ2 149 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPBD1B2RD01 187 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDC42EP2O14613 210 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACOT8O14734 319 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 SURF4O15260 269 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENTPD5O75356 428 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 FSTL3O95633 263 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIST1H2ABP04908 130 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC159P0C7I6 412 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 COX5BP10606 129 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 IDO1P14902 403 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPX2P18283 190 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CA6P23280 308 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD200P41217 278 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIR2DS4P43632 304 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR1E2P47887 323 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB13P51153 203 aa4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms