RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CHIAQ9BZP6 476 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HS3ST1O14792 307 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 BET1O15155 118 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FAHP16930 419 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PAX7P23759 505 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGDIBP52566 201 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CAV3P56539 151 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR51F2Q8NH61 342 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NDNFQ8TB73 568 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RDH5Q92781 318 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TECTBQ96PL2 329 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 AICDAQ9GZX7 198 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ATRXP46100 2492 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 M0R233 179 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TOR1AO14656 332 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ORC5O43913 435 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PMS2P2O95744 297 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HLA-DOBP13765 273 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PRKACAP17612 351 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HTR2CP28335 458 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SHC1P29353 583 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 XKRXQ6PP77 449 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 LYPD8Q6UX82 237 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DOCK7Q96N67 2140 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TIMP4Q99727 224 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MED28Q9H204 178 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCD4O14678 606 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SCGNO76038 276 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RLN2P04090 185 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NGFRP08138 427 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CTSSP25774 331 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HAAOP46952 286 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 BCAP31P51572 246 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HES1Q14469 280 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC17A1Q14916 467 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK10Q15131 360 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HFEQ30201 348 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR4K15Q8NH41 348 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OPALINQ96PE5 141 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GPR27Q9NS67 375 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.27□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 DEGS1O15121 323 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 KNG1P01042 644 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 AMY2AP04746 511 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 ANXA3P12429 323 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 ACHEP22303 614 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 TMBIM6P55061 237 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 Q8N402 240 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms