RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 G3V2T6 193 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 J3QW42 95 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 M0R129 80 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CD5LO43866 347 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CDC14BO60729 498 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 GLCEO94923 617 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 HMGN1P05114 100 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 FCGR1AP12314 374 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 KITLGP21583 273 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 EPHA2P29317 976 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS12P56730 875 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ACTR3P61158 418 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ECH1Q13011 328 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PCGF3Q3KNV8 242 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TEX30Q5JUR7 227 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 KDM4DQ6B0I6 523 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZR03 302 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 COLCA1Q6ZS62 124 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CPOQ8IVL8 374 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR5AS1Q8N127 324 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR6N2Q8NGY6 317 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ST7LQ8TDW4 575 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SLAMF6Q96DU3 332 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MARCH7Q9H992 704 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CHODLQ9H9P2 273 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 KRT84Q9NSB2 600 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CACNG2Q9Y698 323 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PLSCR5A0PG75 271 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf63A6NC05 138 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SAC3D1A6NKF1 404 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 H3BNX3 289 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 M0R135 149 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SELENOFO60613 162 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 LILRA1O75019 489 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MT-ND5P03915 603 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PAICSP22234 425 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ACHEP22303 614 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TUBG1P23258 451 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 GSTT1P30711 240 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 IL2RGP31785 369 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 RBMXP38159 391 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 KLHL12Q53G59 568 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 FAM209AQ5JX71 171 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T2Q6IF00 324 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 FBXW12Q6X9E4 464 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 USP51Q70EK9 711 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SPATC1Q76KD6 591 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DPY19L4Q7Z388 723 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TIGD4Q8IY51 512 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 HAVCR1Q96D42 359 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF799Q96GE5 643 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 COG8Q96MW5 612 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 INTS14Q96SY0 518 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 AMELYQ99218 206 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PKP2Q99959 881 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 COPS4Q9BT78 406 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SOX7Q9BT81 388 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SAP30LQ9HAJ7 183 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CENPMQ9NSP4 180 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OAZ3Q9UMX2 235 aa12.69□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SONP18583 2426 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 WNT9BO14905 357 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 LCATP04180 440 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ADH4P08319 380 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TACSTD2P09758 323 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 RAC2P15153 192 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SLC2A5P22732 501 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PRKXP51817 358 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 BLVRAP53004 296 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TPTEP56180 551 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ESRRGP62508 458 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SNAPC1Q16533 368 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SNAI3Q3KNW1 292 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF540Q8NDQ6 660 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR5L1Q8NGL2 311 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 POM121Q96HA1 1249 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHA8Q96JA3 519 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CIB1Q99828 191 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 NARFLQ9H6Q4 476 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms