RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 AMER3Q8N944 861 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HRH4Q9H3N8 390 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 AGAP14A8MT82 685 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SDHBP21912 280 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OPCMLQ14982 345 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB124Q8NES8 71 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35B4Q969S0 331 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RFX2P48378 723 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF117Q03924 483 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 AQP6Q13520 282 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf49Q96BT1 292 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXB1Q99853 325 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MYBPHQ13203 477 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52I2Q8NH67 350 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR119Q8TDV5 335 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FABP7O15540 132 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHA2P29317 976 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0B4J2A0 478 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R1B8 84 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FADS1O60427 444 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 GLRA1P23415 457 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXD12P35452 270 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 POU4F3Q15319 338 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZIC1Q15915 447 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FJX1Q86VR8 437 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R296 226 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FABP5Q01469 135 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF766Q5HY98 468 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CD276Q5ZPR3 534 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 NTN4Q9HB63 628 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QAP02745 245 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM157BP0CG42 384 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PCSK6P29122 969 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HNF4GQ14541 408 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35G3Q8N808 338 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PLK3Q9H4B4 646 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ARPC3O15145 178 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 THBS3P49746 956 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HES1Q14469 280 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 GFRALQ6UXV0 394 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM235A6NFC5 223 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ALOX5APP20292 161 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TGM4P49221 684 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TLE4Q04727 773 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 NKG7Q16617 165 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf73Q69YU5 71 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RDH5Q92781 318 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0U1RQK1 487 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A1P53007 311 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 UHRF2Q96PU4 802 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM60AQ9NP50 221 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MOSPD3O75425 235 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms