RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 HAAOP46952 286 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 IP6K3Q96PC2 410 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TGM1P22735 817 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FOXF1Q12946 379 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 AGERQ15109 404 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CDC20BQ86Y33 519 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FIGNL2A6NMB9 653 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC61Q9BV99 259 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZNB5 142 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SEH1LQ96EE3 360 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF718Q3SXZ3 478 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 GFRALQ6UXV0 394 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 KCNRGQ8N5I3 272 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 ATF6BQ99941 703 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 MED9Q9NWA0 146 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 RNF150Q9ULK6 438 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FRG2CA6NGY1 282 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FABP1P07148 127 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 PI3P19957 117 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 CTRB1P17538 263 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 METAP1P53582 386 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CTRB2Q6GPI1 263 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ST8SIA1Q92185 356 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM129A0AVI4 362 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ARPC3O15145 178 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SEMG1P04279 462 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 RFX2P48378 723 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SLC51BQ86UW2 128 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TVP23CQ96ET8 276 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 LRFN5Q96NI6 719 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FAM96BQ9Y3D0 163 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 C20orf202A1L168 122 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 MLF1P58340 268 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FN3KRPQ9HA64 309 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 GPR37O15354 613 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CSN1S1P47710 185 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM200CA6NKL6 621 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TGFBR1P36897 503 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 AKR7LQ8NHP1 331 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ORAI1Q96D31 301 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV3-25P01717 112 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ADH4P08319 380 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SOX18P35713 384 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TBX21Q9UL17 535 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 DIO1P49895 249 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SHBQ15464 509 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 OR13C8Q8NGS7 320 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 AK3Q9UIJ7 227 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 R4GMQ9 66 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 TCEAL7Q9BRU2 100 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 NARFLQ9H6Q4 476 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 AQP7P3A6NL99 342 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TEX101Q9BY14 249 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SPACA1Q9HBV2 294 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ISL1P61371 349 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 GABRG1Q8N1C3 465 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 OR8U1Q8NH10 309 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GUL6 1792 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 XRCC2O43543 280 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CTXN2P0C2S0 81 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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