RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FITM1A5D6W6 292 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 XRCC2O43543 280 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 EPHA1P21709 976 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 MVDP53602 400 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 LILRB2Q8N423 598 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 H7C1Q1 480 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 DUSP2Q05923 314 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ARL11Q969Q4 196 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CMTM3Q96MX0 182 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 GUSBP08236 651 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SRPXP78539 464 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CLN3Q13286 438 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SMUG1Q53HV7 270 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ST8SIA4Q92187 359 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 GPR173Q9NS66 373 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 BET1O15155 118 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 EFEMP2O95967 443 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 IFNA2P01563 188 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 BANF2Q9H503 90 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR6C6A6NF89 314 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RNF212BA8MTL3 300 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SMCO3A2RU48 225 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF728P0DKX0 622 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PNLIPP16233 465 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RGS19P49795 217 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PCK2Q16822 640 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 WDFY2Q96P53 400 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 LRP12Q9Y561 859 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 GPR137BO60478 399 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NXPH2O95156 264 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CD226Q15762 336 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SULT1C2O00338 296 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SERPINA7P05543 415 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ACER2Q5QJU3 275 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RAB39BQ96DA2 213 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PMP2P02689 132 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 PPP3CBP16298 524 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 IFITM3Q01628 133 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 DHRS13Q6UX07 377 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RNF170Q96K19 258 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 HINT2Q9BX68 163 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RGCCQ9H4X1 137 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SIP14410 1827 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC17A2O00624 439 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 BHLHE40O14503 412 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 KIR2DL3P43628 341 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 RHEBQ15382 184 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-202ENST00000320031 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms