RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SGTBQ96EQ0 304 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TOR3AQ9H497 397 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 STARD10Q9Y365 291 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR91A4D1P6 747 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 OOEPA6NGQ2 149 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 F5H5P2 479 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 XKRYO14609 159 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TPST1O60507 370 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7A10O76100 309 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 GLCEO94923 617 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R3DO95685 299 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF2P01344 180 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM153BP0C7A2 387 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 IL12AP29459 219 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 GRK5P34947 590 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP2P41181 271 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 CD200P41217 278 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 STX1BP61266 288 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 FMODQ06828 376 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ECH1Q13011 328 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 STX3Q13277 289 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 AANATQ16613 207 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ST8SIA4Q92187 359 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS33AQ96AX1 596 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ECSITQ9BQ95 431 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP28Q9H239 520 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 POLE4Q9NR33 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BUX3 64 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EIL1 84 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 DVL1O14640 695 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC3O15379 428 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFB3O43676 98 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ITM2AO43736 263 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 AHCYL1O43865 530 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10H3O60404 316 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM20BO75063 409 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHA1P01876 353 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNW1P05000 195 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLL1P15814 213 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP1P29972 269 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GSK3BP49841 420 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2E1P51965 193 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8G1Q15617 311 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MICBQ29980 383 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM201AQ5SY85 155 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SSX3Q99909 188 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 HAO1Q9UJM8 370 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.46□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MED31Q9Y3C7 131 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms