RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CENPMQ9NSP4 180 aa24.97■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 COMMD9Q9P000 198 aa24.97■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 SUSD2Q9UGT4 822 aa24.97■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 OR2F2O95006 317 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 OR2F1Q13607 317 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A24Q8N4F4 322 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 FGGYQ96C11 551 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 FANCFQ9NPI8 374 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 CTSFQ9UBX1 484 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 VSIG4Q9Y279 399 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 EXPH5Q8NEV8 1989 aa24.96■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 CDNFQ49AH0 187 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 KLHL24Q6TFL4 600 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 LYG2Q86SG7 212 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 OR10H5Q8NGA6 315 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 DMRTA2Q96SC8 542 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 PISDQ9UG56 409 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 FBXO4Q9UKT5 387 aa24.95■■□□□ 1.59
UBP1-201ENST00000283628 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PIAS2O75928 621 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB25P24278 435 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 GSK3AP49840 483 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CXADRP78310 365 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 HYAL4Q2M3T9 481 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C11orf87Q6NUJ2 197 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 OR1M1Q8NGA1 313 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 OR4S1Q8NGB4 309 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FAHD2AQ96GK7 314 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TGIF2Q9GZN2 237 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TNFSF18Q9UNG2 199 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa24.95■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TTRP02766 147 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 WDFY1Q8IWB7 410 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PXT1Q8NFP0 134 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 NKD1Q969G9 470 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 SLAMF6Q96DU3 332 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C5orf34Q96MH7 638 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 NPAS1Q99742 590 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PDCD10Q9BUL8 212 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 MED29Q9NX70 200 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FBLN5Q9UBX5 448 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa24.94■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 WIPF3A6NGB9 483 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 IL2RAP01589 272 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TBPP20226 339 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FBXW4P57775 412 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 QRFPP83859 136 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 DNTTIP1Q9H147 329 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FGF21Q9NSA1 209 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 KLHL13Q9P2N7 655 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 FER1L5A0AVI2 2057 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 VSTM2BA6NLU5 285 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 SYT7O43581 403 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 GNALP38405 381 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 UNC119Q13432 240 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 NKPD1Q17RQ9 610 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CD163Q86VB7 1156 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 DTWD2Q8NBA8 298 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C11orf40Q8WZ69 217 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 RASL12Q9NYN1 266 aa24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PNV4 684 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C17orf107Q6ZR85 190 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 COX15Q7KZN9 410 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 OR52N4Q8NGI2 321 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 OR5D14Q8NGL3 314 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ST8SIA4Q92187 359 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CLDN23Q96B33 292 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 PBOV1Q9GZY1 135 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 SLC5A6Q9Y289 635 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 LIPT2A6NK58 231 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 BCL2L11O43521 198 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CSN2P05814 226 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 GLB1P16278 677 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 BTN1A1Q13410 526 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 C3orf33Q6P1S2 294 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 TFAP2EQ6VUC0 442 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 NUBPLQ8TB37 319 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 MITD1Q8WV92 249 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 SRPK3Q9UPE1 567 aa24.92■■□□□ 1.58
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms