RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 APCDD1LQ8NCL9 501 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 AMELYQ99218 206 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PBDC1Q9BVG4 233 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 WNT6Q9Y6F9 365 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 AHSA1O95433 338 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 RENP00797 406 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CD5P06127 495 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 FCGR3AP08637 254 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CX3CR1P49238 355 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TEX30Q5JUR7 227 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PLPP4Q5VZY2 271 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF550Q7Z398 422 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 RD3Q7Z3Z2 195 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CXorf40AQ8TE69 158 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PMM1Q92871 262 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TCTN2Q96GX1 697 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM8Q96KF7 97 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 OR10C1Q96KK4 312 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SNX22Q96L94 193 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SOX7Q9BT81 388 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 OR11A1Q9GZK7 315 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 LUZP4Q9P127 313 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CYP8B1Q9UNU6 501 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0B4J2E0 115 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GX12 115 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 OR5H15A6NDH6 313 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 OR5H1A6NKK0 313 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 XKRYO14609 159 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CSTAP01040 98 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 THBS1P07996 1170 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF735P0CB33 412 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 C5AR1P21730 350 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 FCRL6Q6DN72 434 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TANGO2Q6ICL3 276 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 HPSE2Q8WWQ2 592 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 BCO1Q9HAY6 547 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PDE7BQ9NP56 450 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 INSL5Q9Y5Q6 135 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TNFSF12O43508 249 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJB6O75190 326 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ENPP2Q13822 863 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 OR10G6Q8NH81 332 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TET1Q8NFU7 2136 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 RAMP1O60894 148 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT14O95848 222 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 HEXBP07686 556 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SOD3P08294 240 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 KLK2P20151 261 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SULT1A2P50226 295 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 LSM6P62312 80 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PDGFRLQ15198 375 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM225Q6GV28 225 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SHISA5Q8N114 240 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 C4orf45Q96LM5 186 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CASD1Q96PB1 797 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 IFITM10A6NMD0 228 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 XRCC2O43543 280 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CSTBP04080 98 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 COX5BP10606 129 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ALOX5APP20292 161 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 RAB28P51157 221 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM33P57088 247 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 CLEC18BQ6UXF7 455 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 OR2A1Q8NGT9 310 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SMARCD2Q92925 531 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF681Q96N22 645 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT9Q9BW91 350 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-201ENST00000283228 B9D1Q9UPM9 204 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms