RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TUSC1Q2TAM9 212 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PCGF3Q3KNV8 242 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CT45A2Q5DJT8 189 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 LEG1Q6P5S2 330 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ST8SIA4Q92187 359 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GINS4Q9BRT9 223 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 UPB1Q9UBR1 384 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 HIF3AQ9Y2N7 669 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL8A6PVC2 850 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN4O14817 238 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAIN1P0CW23 69 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PMP22Q01453 160 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF766Q5HY98 468 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 BVESQ8NE79 360 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6K3Q8NGY3 331 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPC5LQ9BPX5 153 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 Q9N2J8 555 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 G3V3Y1 287 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A12O75746 678 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 WISP2O76076 250 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC12O95881 172 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CD14P08571 375 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRA2CP18825 462 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-25P63136 954 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPNQ5VXI9 398 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP54Q7Z3B4 507 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH26Q8IXH8 852 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5M9Q8NGP3 310 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC107Q8WV48 283 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TAAR6Q96RI8 345 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL6Q9H0F7 186 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 HPF1Q9NWY4 346 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SHANK1Q9Y566 2161 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV17A0A0B4J275 112 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPC5O15511 151 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD16AO95870 558 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-16P01601 117 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 VSIG10L2P0DP72 767 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC20BQ86Y33 519 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR148Q8TDV2 347 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 RASD2Q96D21 266 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 DNTTIP1Q9H147 329 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A32Q9H2D1 315 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FRRS1LQ9P0K9 344 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GGT3PA6NGU5 568 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SERINC4A6NH21 518 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CSTAP01040 98 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 IL32P24001 234 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CASRP41180 1078 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW4P57775 412 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR85P60893 370 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C16Q8NGL9 310 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 COQ8AQ8NI60 647 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ORAI1Q96D31 301 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 COQ3Q9NZJ6 369 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PRODH2Q9UF12 536 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 EXPH5Q8NEV8 1989 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JMM0 328 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPB8 328 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRS3 328 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR3DP1A8MWS1 328 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SP1P08047 785 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCD3P28288 659 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 AGTR1P30556 359 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SDHAP31040 664 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PPICP45877 212 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10G3Q8NGC4 313 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf58Q96LI9 332 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 DEPPQ9NTK1 212 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FASNP49327 2511 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT1C2O00338 296 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL3P10147 92 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 BTN1A1Q13410 526 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 NHLRC1Q6VVB1 395 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM122BQ7Z309 247 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf49Q96BT1 292 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf198Q9H425 327 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C45A6NMZ5 311 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 LPLP06858 475 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8G3PP0DMU2 310 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 H2BFSP57053 126 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTBP60709 375 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTG1P63261 375 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF273Q14593 569 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FAAP20Q6NZ36 180 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A8Q8TCC7 542 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ZPLD1Q8TCW7 415 aa23.4■■□□□ 1.34
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