RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 COX4I2Q96KJ9 171 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 IL4I1Q96RQ9 567 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 C17orf100A8MU93 164 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 NCR1O76036 304 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 FOSL1P15407 271 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 FBXW12Q6X9E4 464 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SHFQ7M4L6 423 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 OTOSQ8NHW6 89 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 C10orf105Q8TEF2 133 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RNF133Q8WVZ7 376 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 UBE2FQ969M7 185 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CMBLQ96DG6 245 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 C18orf12Q96KH6 178 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MBOAT4Q96T53 435 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 C9orf16Q9BUW7 83 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CR1P17927 2039 aa19.01■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 M0R135 149 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 BAG2O95816 211 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 HPXP02790 462 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 KITLGP21583 273 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB1P43366 347 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 HCCSP53701 268 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 NKPD1Q17RQ9 610 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 NXNL2Q5VZ03 156 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SPATC1Q76KD6 591 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF799Q96GE5 643 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 HRASLS5Q96KN8 279 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ15Q99712 375 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PRRG3Q9BZD7 231 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CENPMQ9NSP4 180 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MTORP42345 2549 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 VWC2LB2RUY7 222 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 TPTEP56180 551 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 DSCR9P59020 149 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RPS7P62081 194 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 COG8Q96MW5 612 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SMR3AQ99954 134 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 REG4Q9BYZ8 158 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 TOR3AQ9H497 397 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PTTG3PQ9NZH4 202 aa19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF878C9JN71 531 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RNF223E7ERA6 249 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 LYNX1G3V0Z9 82 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 DLGAP1O14490 977 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 LYNX1P0DP58 116 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 DAOP14920 347 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RAC2P15153 192 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ALOX5APP20292 161 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 OPRL1P41146 370 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 GGTLC2Q14390 218 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MOGQ16653 247 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CLEC2AQ6UVW9 174 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZR03 302 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RHOUQ7L0Q8 258 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A9Q7RTY1 509 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PRSS45Q7RTY3 260 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 FAM168AQ92567 244 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 STMN2Q93045 179 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SPTSSAQ969W0 71 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 COPS4Q9BT78 406 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 GPR160Q9UJ42 338 aa18.99■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CSPG4Q6UVK1 2322 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PRR32B1ATL7 298 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-46P01743 117 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 LCATP04180 440 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 INHBBP09529 407 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ANPEPP15144 967 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 COL8A2P25067 703 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PRKXP51817 358 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RAD23AP54725 363 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 DRAM2Q6UX65 266 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF786Q8N393 782 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF454Q8N9F8 522 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 OR5L1Q8NGL2 311 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 OR8J1Q8NGP2 316 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 UBASH3BQ8TF42 649 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 YIPF3Q9GZM5 350 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 HAO2Q9NYQ3 351 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 COPS3Q9UNS2 423 aa18.98■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 LYNP07948 512 aa18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ADH4P08319 380 aa18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PDLIM4P50479 330 aa18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF81P51508 661 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms