RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 SPTSSAQ969W0 71 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 MRI1Q9BV20 369 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 DNAJC13O75165 2243 aa14.72□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TTLL8A6PVC2 850 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 UPK1BO75841 260 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF32P17041 273 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CRYGSP22914 178 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 OR3A2P47893 321 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TMPRSS3P57727 454 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 LUZP2Q86TE4 346 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 WNT2BQ93097 391 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TRIB1Q96RU8 372 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SOSTQ9BQB4 213 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC32Q9BV29 185 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 CKLFQ9UBR5 152 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 MALT1Q9UDY8 824 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-201ENST00000225576 A0A1B0GTI1 187 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 OR6C6A6NF89 314 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FABP12A6NFH5 140 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 F5H5K5 113 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SYT7O43581 403 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 DOK2O60496 412 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 CCL1P22362 96 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 PSG4Q00888 419 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 IFITM3Q01628 133 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FAPQ12884 760 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FAM57BQ71RH2 274 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 CMTM3Q96MX0 182 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 GPR137Q96N19 417 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 A0A1B0GVI7 797 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 M0R135 149 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 MAS1P04201 325 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SLC2A1P11166 492 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF12P17014 697 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 CFPP27918 469 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 GUSBP1Q15486 140 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SLC36A2Q495M3 483 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF774Q6NX45 483 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 CNIH2Q6PI25 160 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 XKRXQ6PP77 449 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 DRAM2Q6UX65 266 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 EXTL1Q92935 676 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF799Q96GE5 643 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 PRSS50Q9UI38 385 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SPATA2Q9UM82 520 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 USP24Q9UPU5 2620 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 A0A0U1RQV5 110 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ISPDA4D126 451 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 MEGF11A6BM72 1044 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 TBX1O43435 398 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 PAHP00439 452 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 IGLV3-1P01715 115 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 CD37P11049 281 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ELK1P19419 428 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 MPGP29372 298 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 TPTEP56180 551 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF79Q15937 498 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 PGAM5Q96HS1 289 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-201ENST00000225576 SRRQ9GZT4 340 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms