RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 A0A1W2PS29 197 aa5.73□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 UMAD1C9J7I0 102 aa5.73□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 CRYAAP02489 173 aa5.73□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 ETV1P50549 477 aa5.73□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 PPP2CAP67775 309 aa5.73□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 STK11Q15831 433 aa5.73□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.73□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 BIN3Q9NQY0 253 aa5.72□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 PFN4Q8NHR9 129 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 WBP2Q969T9 261 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 OPALINQ96PE5 141 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.72□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.72□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 C10orf90Q96M02 699 aa5.72□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 CD300LBA8K4G0 201 aa5.72□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 FUT4P22083 530 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 GNG3P63215 75 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 ACSM5Q6NUN0 579 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 PIGCQ92535 297 aa5.72□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 TAAR8Q969N4 342 aa5.72□□□□□ -1.49
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