RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RCN3	Q96D15	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR21	Q99679	349 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC7	O00311	574 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB29	O14966	203 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1I1	O60431	355 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GMDS	O60547	372 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CD1E	P15812	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF12	P17014	697 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K8	P41279	467 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GNPDA1	P46926	289 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PKNOX1	P55347	436 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PSME3	P61289	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GAGE5	Q13069	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GAGE6	Q13070	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FLOT2	Q14254	428 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	LAGE3	Q14657	143 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CD226	Q15762	336 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616		A8MUA0	341 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BRI3	O95415	125 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf105	O95561	183 aa		4.15	□□□□□ -1.74

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