RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FRG2C	A6NGY1	282 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FADS1	O60427	444 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ICOSLG	O75144	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR4E1	P0C645	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC16A1	P53985	500 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CDK20	Q8IZL9	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MED20	Q9H944	212 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SELL	P14151	372 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EDNRA	P25101	427 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CD81	P60033	236 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TOMM20	Q15388	145 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LMF1	Q96S06	567 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CDC6	Q99741	560 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0B4J2E0	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GWA3	101 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GX12	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPK0	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AP4M1	O00189	453 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SULT2B1	O00204	365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CDC42EP2	O14613	210 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CSTA	P01040	98 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CD74	P04233	296 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MPL	P40238	635 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	P2RY4	P51582	365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PON3	Q15166	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GFI1	Q99684	422 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MFNG	O00587	321 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR2T1	O43869	369 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CLN5	O75503	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ONECUT2	O95948	504 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	HEXB	P07686	556 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GTF2F2	P13984	249 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PTN	P21246	168 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CFP	P27918	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CD34	P28906	385 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SDHA	P31040	664 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PPT1	P50897	306 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CAV2	P51636	162 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TAS2R19	P59542	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AWAT2	Q6E213	333 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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