RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFSF4P23510 183 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 RGS6P49758 472 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 LMO4P61968 165 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 LCN8Q6JVE9 175 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 LINC00346Q8IVM7 164 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC26A10Q8NG04 563 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2Z1Q8NG97 314 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5L1Q8NGL2 311 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 OR51F2Q8NH61 342 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 BTBD10Q9BSF8 475 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF665Q9H7R5 613 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 HIF1ANQ9NWT6 349 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 PTTG3PQ9NZH4 202 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ATPIF1Q9UII2 106 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ISPDA4D126 451 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 GASTP01350 101 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ADH4P08319 380 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGEA2P43356 314 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 MS4A2Q01362 244 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC3A1Q07837 685 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 AQP11Q8NBQ7 271 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 PTP4A1Q93096 173 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM186Q96B77 213 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 PITX2Q99697 317 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 REEP1Q9H902 201 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D23Q9NUY8 699 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 U3KQV3 271 aa24.61■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 MXRA5Q9NR99 2828 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 T-ENOLP0DO92 83 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ANPEPP15144 967 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4C15Q8NGM1 316 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 HAVCR1Q96D42 359 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB39BQ96DA2 213 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 COQ7Q99807 217 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 KITLGP21583 273 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST1H3AP68431 136 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 COX10Q12887 443 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK5R2Q13319 367 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T5Q6IEZ7 315 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST2H3AQ71DI3 136 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB46Q86UZ6 589 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5AS1Q8N127 324 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 CYB561A3Q8NBI2 242 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 PROKR2Q8NFJ6 384 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T29Q8NH02 315 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 GAL3ST1Q99999 423 aa24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 UBOX5O94941 541 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 CD55P08174 381 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 RAC2P15153 192 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF823P16415 610 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 SPRNQ5BIV9 151 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 ACSM5Q6NUN0 579 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 SPATA3Q8NHX4 192 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 CLPTM1LQ96KA5 538 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 THTPAQ9BU02 230 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-215ENST00000621029 DNHD1Q96M86 4753 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 J3QW42 95 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 PYCR1P32322 319 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 THBS2P35442 1172 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ERFP50548 548 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC18B1Q6NT16 456 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 CFAP77Q6ZQR2 320 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ATG16L2Q8NAA4 619 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ASB9Q96DX5 294 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 FAHD2AQ96GK7 314 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TSSK6Q9BXA6 273 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 VNN3Q9NY84 501 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R1Q9NYW7 299 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 IL20Q9NYY1 176 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 UBAP1Q9NZ09 502 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 F5H5K5 113 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 BHLHE40O14503 412 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SURF4O15260 269 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFRSF1AP19438 455 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 MICAQ29983 383 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T2Q6IF00 324 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 Q6ZR03 302 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T4Q8NH00 348 aa24.56■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAV20A0A0B4J274 112 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 SOX14O95416 240 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ECH1Q13011 328 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8D4Q8NGM9 314 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 ATF6BQ99941 703 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR76Q9H967 626 aa24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms