RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SYT4Q9H2B2 425 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 PTTG3PQ9NZH4 202 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 ATPIF1Q9UII2 106 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 POM121CA8CG34 1229 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 PTP4A3O75365 173 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 SDHAP31040 664 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 MTNR1AP48039 350 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 39.5
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PTPRF-216ENST00000617451 CBLL1Q75N03 491 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 RRM2BQ7LG56 351 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD19PQ9H560 264 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 NRIP3Q9NQ35 241 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa20.86■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF205O95201 554 aa20.86■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 LEG1Q6P5S2 330 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 BTNL3Q6UXE8 466 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 KLBQ86Z14 1044 aa20.86■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 RCN3Q96D15 328 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 DOCK11Q5JSL3 2073 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 TGP01266 2768 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 MLNRO43193 412 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 GNB2P62879 340 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 HIST2H3AQ71DI3 136 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 SERPINA1P01009 418 aa20.83■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 TREML4Q6UXN2 200 aa20.83■□□□□ 0.93
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PTPRF-216ENST00000617451 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRF-216ENST00000617451 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PRQ8 180 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC30A6NM36 301 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 IQCF6A8MYZ5 107 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 F5H5P2 479 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 GSTA4O15217 222 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRF-216ENST00000617451 GPANK1O95872 356 aa20.82■□□□□ 0.92
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