RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606828.2

MED16-211, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MED16, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-211ENST00000606828 CRYBB2P43320 205 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ECH1Q13011 328 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 PSG7Q13046 419 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 TRIP10Q15642 601 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 FAM166AQ6J272 317 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 PTP4A1Q93096 173 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 YIPF5Q969M3 257 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 DIRC2Q96SL1 478 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 PITX2Q99697 317 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 EGLN1Q9GZT9 426 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 STARD10Q9Y365 291 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.66□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 H3BN98 237 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 LMX1BO60663 402 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 FKBP6O75344 327 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 RP2O75695 350 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ATP5HO75947 161 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 IGHV1-46P01743 117 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ADH4P08319 380 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 DBHP09172 617 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ZNF3P17036 446 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 PYCR1P32322 319 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 CBX1P83916 185 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 CRMP1Q14194 572 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 HFEQ30201 348 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 USP51Q70EK9 711 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 CMBLQ96DG6 245 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 TMEM160Q9NX00 188 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.65□□□□□ -0.54
MED16-211ENST00000606828 TGFAP01135 160 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 RAC2P15153 192 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 KITLGP21583 273 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 FMO3P31513 532 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 BLVRAP53004 296 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 SLC25A1P53007 311 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 HAVCR1Q96D42 359 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 ATF6BQ99941 703 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 POFUT1Q9H488 388 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 MSL2Q9HCI7 577 aa11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 TVP23AA6NH52 213 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 CLDN25C9JDP6 229 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 F5H5K5 113 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 CD55P08174 381 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 TNFSF4P23510 183 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 IL2RGP31785 369 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 ERFP50548 548 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 CDK5R2Q13319 367 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 CCNIQ14094 377 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 CCL17Q92583 94 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 SPTSSAQ969W0 71 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 TIMD4Q96H15 378 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 MAP6Q96JE9 813 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 SOX7Q9BT81 388 aa11.63□□□□□ -0.55
MED16-211ENST00000606828 BEX2Q9BXY8 128 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms