RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 MEP1BQ16820 701 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR31Q8NA23 367 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 GJC3Q8NFK1 279 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A15Q9Y619 301 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC1A7O00341 560 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SELENOFO60613 162 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM20BO75063 409 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SPARCP09486 303 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2T7P0C7T2 308 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPZA2P47755 286 aa20.48■□□□□ 0.87
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CAPNS1-214ENST00000592483 GSG1Q2KHT4 349 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 C3orf36Q3SXR2 165 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST2H3AQ71DI3 136 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2T27Q8NH04 317 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 OTOSQ8NHW6 89 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO17Q96EF6 278 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf198Q9H425 327 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 INPP5EQ9NRR6 644 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GNT2Q9NY97 397 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF224Q9NZL3 707 aa20.48■□□□□ 0.87
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CAPNS1-214ENST00000592483 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB36O95755 333 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PTHP01270 115 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PPA1Q15181 289 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 DPY19L4Q7Z388 723 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC35F2Q8IXU6 374 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LGALS12Q96DT0 336 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF121Q9H920 327 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NGBQ9NPG2 151 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF32P17041 273 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 DCKP27707 260 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB1AP62820 205 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PLP2Q04941 152 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TAB1Q15750 504 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF786Q8N393 782 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 HTRA1Q92743 480 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 JAM3Q9BX67 310 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 AMBNQ9NP70 447 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-214ENST00000592483 J3QRE1 110 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 LYNP07948 512 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 COX5BP10606 129 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ALOX5APP20292 161 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ECH1Q13011 328 aa20.45■□□□□ 0.86
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CAPNS1-214ENST00000592483 EGFL6Q8IUX8 553 aa20.45■□□□□ 0.86
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CAPNS1-214ENST00000592483 OR52N5Q8NH56 324 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2H1Q9GZK4 316 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SGCEO43556 437 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV3-15P01624 115 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHA1P01876 353 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 THBS2P35442 1172 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MDP1Q86V88 176 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC00346Q8IVM7 164 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 OR4F15Q8NGB8 312 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52I1Q8NGK6 324 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ST7LQ8TDW4 575 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 GGHQ92820 318 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MYDGFQ969H8 173 aa20.44■□□□□ 0.86
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