RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 EI24O14681 340 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TNFSF11O14788 317 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 FGF16O43320 207 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ERI3O43414 337 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MBTPS2O43462 519 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CHST1O43916 411 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PRAF2O60831 178 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF217O75362 1048 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CA11O75493 328 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 UPK1BO75841 260 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2ABP04908 130 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2ADP20671 130 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 KITLGP21583 273 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MATN1P21941 496 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 S100A2P29034 98 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 TMPRSS3P57727 454 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 DEFA3P59666 94 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 RPL15P61313 204 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DLK1P80370 383 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 OR6K2Q8NGY2 324 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 RPEQ96AT9 228 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM19Q96E16 107 aa2.69□□□□□ -1.98
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PTPRM-204ENST00000577468 PYURFQ96I23 114 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 BTN2A3PQ96KV6 586 aa2.69□□□□□ -1.98
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