RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568232.1

CLK3-222, Transcript of CDC like kinase 3, human

Gene CLK3, Length 958 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK3-222	ENST00000568232	FMO6P	O60774	539 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	LYPD3	O95274	346 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	SCG5	P05408	212 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	BPGM	P07738	259 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	IRF2	P14316	349 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CD47	Q08722	323 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	HHAT	Q5VTY9	493 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	C11orf88	Q6PI97	169 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	FGFRL1	Q8N441	504 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	OR5R1	Q8NH85	324 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	MEGF11	A6BM72	1044 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CENPBD1	B2RD01	187 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232		H3BUX3	64 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232		M0R3H8	397 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	NPFF	O15130	113 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	FAM20B	O75063	409 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	RAC2	P15153	192 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	TUBG1	P23258	451 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	AQP2	P41181	271 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	HTR5A	P47898	357 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	KLRD1	Q13241	179 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	MAB21L1	Q13394	359 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	MPPED2	Q15777	294 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CDON	Q4KMG0	1287 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	NXN	Q6DKJ4	435 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	HDX	Q7Z353	690 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	SPERT	Q8NA61	448 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ZBTB18	Q99592	522 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	MCHR1	Q99705	422 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232		U3KQK5	164 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232		A0A1B0GVI7	797 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232		A0A1W2PPL8	197 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	MEIOC	A2RUB1	952 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	WDR91	A4D1P6	747 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CHP2	O43745	196 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	PAH	P00439	452 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	GSK3A	P49840	483 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	PCBD1	P61457	104 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	VSNL1	P62760	191 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	POU4F2	Q12837	409 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	NPTX1	Q15818	432 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	OGFOD2	Q6N063	350 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF613	Q6PF04	617 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	IFT20	Q8IY31	132 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	C17orf50	Q8WW18	174 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	RORB	Q92753	470 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CENPH	Q9H3R5	247 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	EMC7	Q9NPA0	242 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	INIP	Q9NRY2	104 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	KPTN	Q9Y664	436 aa		9.6	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232		A0A1W2PRX2	142 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	TLDC2	A0PJX2	215 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	CLIC1	O00299	241 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	DVL1	O14640	695 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	DOK2	O60496	412 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	GYPA	P02724	150 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	IL6	P05231	212 aa		9.59	□□□□□ -0.87
CLK3-222	ENST00000568232	COX5B	P10606	129 aa		9.59	□□□□□ -0.87

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