RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561610.1

PPP4C-202, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-202ENST00000561610 COPS4Q9BT78 406 aa16.08■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.08■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.08■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.08■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 B9A039 149 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PEX2P28328 305 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PCSK6P29122 969 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 GCH1P30793 250 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 WNT5AP41221 380 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SHFQ7M4L6 423 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.07■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 CD8AP01732 235 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLC6A9P48067 706 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PTH2RP49190 550 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ATP5J2P56134 94 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 HIST1H3AP68431 136 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 HIST2H3AQ71DI3 136 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 DTX2Q86UW9 622 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 THEM6Q8WUY1 208 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SPTSSAQ969W0 71 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLAMF6Q96DU3 332 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MAP6Q96JE9 813 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MBOAT4Q96T53 435 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.06■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PSKH1P11801 424 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLC2A5P22732 501 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 HSD11B1P28845 292 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 TPTEP56180 551 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PPP1CBP62140 327 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ECH1Q13011 328 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 LRP11Q86VZ4 500 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 GID4Q8IVV7 300 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MBD6Q96DN6 1003 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 TEAD3Q99594 435 aa16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 CCDC182A6NF36 153 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 CLPTM1O96005 669 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 NGFP01138 241 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ATP6V1E1P36543 226 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PRKXP51817 358 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 TEX30Q5JUR7 227 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 TIGD4Q8IY51 512 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 CYGBQ8WWM9 190 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 FOXC2Q99958 501 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 VCXQ9H320 206 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.04■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF878C9JN71 531 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 LCATP04180 440 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 LYNP07948 512 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 H2BFMP0C1H6 154 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLC15A1P46059 708 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 RGS6P49758 472 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 HCCSP53701 268 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLC34A1Q06495 639 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 EFNB3Q15768 340 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MSMPQ1L6U9 139 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 C11orf71Q6IPW1 123 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SLC16A9Q7RTY1 509 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 SNX33Q8WV41 574 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 UBE2FQ969M7 185 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ABHD6Q9BV23 337 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 TMUB1Q9BVT8 246 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 MARCH7Q9H992 704 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 PLCE1Q9P212 2302 aa16.03■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 M0R135 149 aa16.02■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PPP4C-202ENST00000561610 ADRA2AP08913 450 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms