RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC7A6Q92536 515 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RDH5Q92781 318 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATF6BQ99941 703 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDADC1Q9BWV3 514 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHODLQ9H9P2 273 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CIB2O75838 187 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCR1O76036 304 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HPXP02790 462 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPI1P17947 270 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FMO3P31513 532 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF81P51508 661 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDK5Q00535 292 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCNIQ14094 377 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CARTPTQ16568 116 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ALKBH6Q3KRA9 238 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TEX30Q5JUR7 227 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAHD1Q6P587 224 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CORO6Q6QEF8 472 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00346Q8IVM7 164 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PARP8Q8N3A8 854 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATG16L2Q8NAA4 619 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR5L1Q8NGL2 311 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR5K1Q8NHB7 308 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DIRC2Q96SL1 478 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC25A19Q9HC21 320 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF17Q9P2E2 1029 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZFHX3Q15911 3703 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DBHP09172 617 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TACSTD2P09758 323 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF23P17027 643 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KITLGP21583 273 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAICSP22234 425 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRKACGP22612 351 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FASP25445 335 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAGEB1P43366 347 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ENTPD1P49961 510 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSG7Q13046 419 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GGTLC2Q14390 218 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GINS1Q14691 196 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC01590Q5TEZ4 76 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBXW12Q6X9E4 464 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COLCA1Q6ZS62 124 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIPK1Q86Z02 1210 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IQCF1Q8N6M8 205 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNRF4Q8WWF5 429 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAP6Q96JE9 813 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PITX2Q99697 317 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STARD10Q9Y365 291 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AP4S1Q9Y587 144 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TVP23AA6NH52 213 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SURF4O15260 269 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RP2O75695 350 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV1-46P01743 117 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HMGN1P05114 100 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GYPBP06028 91 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD55P08174 381 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACSM4P0C7M7 580 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLUP10909 449 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAC2P15153 192 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACSM5Q6NUN0 579 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LYPD4Q6UWN0 246 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR51L1Q8NGJ5 315 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10S1Q8NGN2 331 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTP4A1Q93096 173 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HAVCR1Q96D42 359 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POM121Q96HA1 1249 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TEX12Q9BXU0 123 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POFUT1Q9H488 388 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR76Q9H967 626 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MARCH7Q9H992 704 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRODHO43272 600 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GLCEO94923 617 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCA1O95477 2261 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV4-31P0DP07 118 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POU1F1P28069 291 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRYBB2P43320 205 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GZMKP49863 264 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHN2P52757 468 aa13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms