RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	CD40LG	P29965	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SOX2	P48431	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PSMD7	P51665	324 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PPP5C	P53041	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PPP3R1	P63098	170 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM127	O75204	238 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	WNT11	O96014	354 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ISG15	P05161	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ACHE	P22303	614 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TNFSF8	P32971	234 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	HTRA1	Q92743	480 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	KCNJ15	Q99712	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ATF6B	Q99941	703 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610		J3QRK9	145 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SLC19A2	O60779	497 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ETV6	P41212	452 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	TMPRSS3	P57727	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	HIST1H3A	P68431	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ECH1	Q13011	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	OR14I1	A6ND48	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	CTSS	P25774	331 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PRKX	P51817	358 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	GALK2	Q01415	458 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	AHRR	A9YTQ3	701 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PIN1P1	O15428	100 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	SGCE	O43556	437 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	TGM6	O95932	706 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	B4GALT1	P15291	398 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	CX3CR1	P49238	355 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	TBR1	Q16650	682 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ATG13-222	ENST00000534610	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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