RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PANX2Q96RD6 677 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SAMD10Q9BYL1 202 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 C1orf21Q9H246 121 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DUSP21Q9H596 190 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CWH43Q9H720 699 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 COQ10BQ9H8M1 238 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NMRAL1Q9HBL8 299 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 POLE4Q9NR33 117 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RHBDL2Q9NX52 303 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IL37Q9NZH6 218 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNF14Q9UBS8 474 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CTNNA3Q9UI47 895 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 VANGL2Q9ULK5 521 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NPTNQ9Y639 398 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNE3Q9Y6H6 103 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 APCP25054 2843 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TECTAO75443 2155 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CACNA1EQ15878 2313 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1B0GUH1 482 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1B0GWJ7 208 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1W2PPV9 198 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 GABRR3A8MPY1 467 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 C15orf65H3BRN8 121 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 H7C417 338 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 GOSR2O14653 212 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SOX15O60248 233 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR7C2O60412 319 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SURF6O75683 361 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SCGNO76038 276 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SEMA3DO95025 777 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLDN9O95484 217 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 PAHP00439 452 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 FGGP02679 453 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CRYGBP07316 175 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 IQCF3P0C7M6 154 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CD28P10747 220 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CD37P11049 281 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 STMN1P16949 149 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHMLP26374 656 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 MDH1P40925 334 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 GRIA1P42261 906 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCT3P49368 545 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 ACOT2P49753 483 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBE2E1P51965 193 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPX6P59796 221 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPL23P62829 140 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 ACTG2P63267 376 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRR3P79522 188 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 FMODQ06828 376 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SIGLEC14Q08ET2 396 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 ECH1Q13011 328 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 TPBGQ13641 420 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 DMC1Q14565 340 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF141Q15928 474 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SP6Q3SY56 376 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC36A3Q495N2 470 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 LUZP6Q538Z0 58 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 DEGS2Q6QHC5 323 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 UQCC3Q6UW78 93 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMPPEQ6ZT21 453 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM25Q86YD3 366 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 NKAIN4Q8IVV8 208 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF619Q8N2I2 560 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF645Q8N7E2 425 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 COX18Q8N8Q8 333 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 C11orf72Q8NBR9 251 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 ACTL9Q8TC94 416 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 CXorf40AQ8TE69 158 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 SCFD1Q8WVM8 642 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 C10orf35Q96D05 121 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 COQ2Q96H96 371 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLEKHA8Q96JA3 519 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNF145Q96MT1 663 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms