RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC16A6O15403 523 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 CD8AP01732 235 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM157BP0CG42 384 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 GGTLC2Q14390 218 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 SWI5Q1ZZU3 235 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A30Q5SVS4 291 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 LYPD4Q6UWN0 246 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC16A9Q7RTY1 509 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 DPY19L4Q7Z388 723 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5L1Q8NGL2 311 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1J1Q8NGS3 322 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP6Q96JE9 813 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 MNTQ99583 582 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 APOC1P02654 83 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 POU4F2Q12837 409 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF718Q3SXZ3 478 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM154Q6P9G4 183 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 FAM118AQ9NWS6 357 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 GPRIN2O60269 458 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF250P15622 560 aa23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 TAF13Q15543 124 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 ABHD4Q8TB40 342 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 SYNPRQ8TBG9 265 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 ST7LQ8TDW4 575 aa23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 APOL4Q9BPW4 351 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC182A6NF36 153 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 H7C417 338 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 LYNP07948 512 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 GCH1P30793 250 aa23.08■■□□□ 1.29
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SH3BP2-212ENST00000508338 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC168Q8NDH2 2452 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-212ENST00000508338 M0R129 80 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 PHYHO14832 338 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 PPOXP50336 477 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 OCLNQ16625 522 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 MST1LQ2TV78 715 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 DRAM2Q6UX65 266 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF133Q8WVZ7 376 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNJ15Q99712 375 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 ABHD6Q9BV23 337 aa23.07■■□□□ 1.28
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SH3BP2-212ENST00000508338 VCX3BQ9H321 246 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51B6Q9H340 312 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 LAMP5Q9UJQ1 280 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX15Q9BXT5 2789 aa23.07■■□□□ 1.28
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SH3BP2-212ENST00000508338 F5H5K5 113 aa23.06■■□□□ 1.28
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SH3BP2-212ENST00000508338 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 PTH2RP49190 550 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 ART1P52961 327 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 RIPK1Q13546 671 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10S1Q8NGN2 331 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 ASB17Q8WXJ9 295 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 DOK1Q99704 481 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 CENPMQ9NSP4 180 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 DUSP13Q9UII6 198 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-212ENST00000508338 MAST4O15021 2626 aa23.06■■□□□ 1.28
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