RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RRAGC	Q9HB90	399 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD84	Q9UIB8	345 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMPD2	O60906	423 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	B3GAT3	O94766	335 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HPRT1	P00492	218 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AOAH	P28039	575 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	APLNR	P35414	380 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEACAM6	P40199	344 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCAND1	P57086	179 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GXYLT1	Q4G148	440 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZN92	141 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TOMM40L	Q969M1	308 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEURL3	Q96EH8	262 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	STAC	Q99469	402 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITGB2	P05107	769 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A8	P0DMV1	189 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A9	P0DMV2	189 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5H8	P0DN80	308 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GZMB	P10144	247 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HOXC12	P31275	282 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FZD5	Q13467	585 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF266	Q14584	549 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DECR1	Q16698	335 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDS1	Q92903	461 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM106A	Q96A25	262 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF2	Q99496	336 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPG21	Q9NZD8	308 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PQH9	124 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEGF11	A6BM72	1044 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GJE1	A6NN92	205 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		E9PQ18	207 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		F8VVB4	439 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		F8VWA3	439 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OGG1	O15527	345 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GLCE	O94923	617 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FURIN	P09958	794 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCKBR	P32239	447 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SSR2	P43308	183 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADIRF	Q15847	76 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXL22	Q6P050	247 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM104	Q8NE00	496 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM169	Q96HH4	297 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAPPC6A	O75865	159 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP1R3D	O95685	299 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CKM	P06732	381 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPC1L	P0DKB6	136 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LEG1	Q6P5S2	330 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	S100A7A	Q86SG5	101 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL22RA2	Q969J5	263 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8B4	Q96RC9	309 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BOC	Q9BWV1	1114 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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