RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.65□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 J3QW42 95 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PLPP2O43688 288 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TNFRSF1AP19438 455 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ATP6V1B2P21281 511 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ERFP50548 548 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HIST1H3AP68431 136 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 COX10Q12887 443 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PTP4A1Q93096 173 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 COQ7Q99807 217 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.64□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 COL6A5A8TX70 2615 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 B2RBV5 119 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 IDH3BO43837 385 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 KRT36O76013 467 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HLA-DQA2P01906 255 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 RAC2P15153 192 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR5AS1Q8N127 324 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 FITM2Q8N6M3 262 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OCEL1Q9H607 264 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 NPTNQ9Y639 398 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.63□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 A0A0G2JMP0 313 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 A0A0X1KG70 313 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR6C68A6NDL8 312 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TNFRSF11BO00300 401 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SURF4O15260 269 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SLC36A3Q495N2 470 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 LINC00471Q8N535 108 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TEX29Q8N6K0 151 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PITX2Q99697 317 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 IL19Q9UHD0 177 aa14.62□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 IGHV2-70P01814 119 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SBK2P0C263 348 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HMGA2P52926 109 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SCGB2A2Q13296 93 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR2T2Q6IF00 324 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ST7LQ8TDW4 575 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 NSL1Q96IY1 281 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR2V2Q96R30 315 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TRIM15Q9C019 465 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 MUC13Q9H3R2 512 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.61□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CCNB2O95067 398 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 MAGEA2P43356 314 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 LCN2P80188 198 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 DHFR2Q86XF0 187 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR8G5Q8NG78 346 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ATF6BQ99941 703 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.6□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 F5H5K5 113 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 J3QLI3 93 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms