RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 IL1BP01584 269 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHG4P01861 327 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DRAP01903 254 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OPN1MWP04001 364 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NR2C1P13056 603 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NPR2P20594 1047 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 COX5AP20674 150 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 PCMT1P22061 227 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 GCAP28676 217 aa2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 CA5AP35218 305 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 TAC4Q86UU9 113 aa2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 FTMTQ8N4E7 242 aa2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC127Q96BQ5 260 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF799Q96GE5 643 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35E1Q96K37 410 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF285Q96NJ3 590 aa2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 CTRCQ99895 268 aa2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 ACP6Q9NPH0 428 aa2.14□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 H0YCG3 227 aa2.13□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 THRAP10827 490 aa2.13□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 CXCR2P25025 360 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 AK4P27144 223 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 PMF1Q6P1K2 205 aa2.13□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC65Q8IXS2 484 aa2.13□□□□□ -2.07
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF540Q8NDQ6 660 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 IPMKQ8NFU5 416 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4K14Q8NGD5 310 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR51S1Q8NGJ8 323 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR6K2Q8NGY2 324 aa2.13□□□□□ -2.07
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