RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424		J3QW42	95 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ADH4	P08319	380 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF32	P17041	273 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HNF1A	P20823	631 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A1	P53007	311 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD23A	P54725	363 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK5	Q00535	292 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG4	Q00888	419 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	AQP6	Q13520	282 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CARTPT	Q16568	116 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP11	Q86VZ4	500 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6V1	Q8N148	313 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT3	Q9BQG1	590 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DNHD1	Q96M86	4753 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	COL6A5	A8TX70	2615 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPW3	197 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TF	P02787	698 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LCK	P06239	509 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FMO3	P31513	532 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAPC1	Q16533	368 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNMB1	Q16558	191 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GJC3	Q8NFK1	279 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	COG8	Q96MW5	612 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TSSK2	Q96PF2	358 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DIRC2	Q96SL1	478 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	EMC7	Q9NPA0	242 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFA	P01135	160 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM157B	P0CG42	384 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GCH1	P30793	250 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBB2	P43320	205 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH3B1	P43353	468 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CRMP1	Q14194	572 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	EME1	Q96AY2	570 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CIB1	Q99828	191 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FN3K	Q9H479	309 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf49	A4QMS7	147 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424		B4DSR2	109 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SURF4	O15260	269 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SGCE	O43556	437 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RP2	O75695	350 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	HPX	P02790	462 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH3A2	P51648	485 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH15	P55291	814 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TPK1	Q9H3S4	243 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DCTN6	O00399	190 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MPZL1	O95297	269 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CLPTM1	O96005	669 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL2	P13500	99 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ANPEP	P15144	967 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SPI1	P17947	270 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNO	P22674	350 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	COL8A2	P25067	703 aa		14.74	□□□□□ -0.05

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