RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RBP7	Q96R05	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	AMELY	Q99218	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GFI1	Q99684	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		R4GMQ9	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PQ09	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BML4	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS5	O15539	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HPGDS	O60760	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINI2	O75830	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NCR1	O76036	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	UBL3	O95164	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		P04436	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HPN	P05981	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CALCB	P10092	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TFPI	P10646	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ATF1	P18846	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ELK1	P19419	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SRM	P19623	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CNR1	P21554	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ACHE	P22303	614 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LAP3	P28838	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OTX2	P32243	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMB10	P40306	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RFX2	P48378	723 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CYB561	P49447	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	BID	P55957	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2B6	P58173	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10A3	P58181	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RAC3	P60763	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAM8	P78325	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SCN1B	Q07699	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MELK	Q14680	651 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TOMM20	Q15388	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	STK11	Q15831	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ETFDH	Q16134	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZSR3	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	POC5	Q8NA72	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NSMAF	Q92636	917 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PRRX2	Q99811	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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