RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF774Q6NX45 483 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CORO6Q6QEF8 472 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 SYS1Q8N2H4 156 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 FTMTQ8N4E7 242 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 WDR31Q8NA23 367 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01560Q8TB33 94 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 APH1BQ8WW43 257 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 FCGR1BQ92637 280 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 OR8B4Q96RC9 309 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TBX5Q99593 518 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ALG8Q9BVK2 526 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 JAM3Q9BX67 310 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 OR10A2Q9H208 303 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 GNG8Q9UK08 70 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.49□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 NBASA2RRP1 2371 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 M0R135 149 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 XRCC2O43543 280 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 XPNPEP2O43895 674 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 GPANK1O95872 356 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV1-44P01699 117 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 IGHA1P01876 353 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CDK1P06493 297 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 PATE4P0C8F1 98 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 SELEP16581 610 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CRHBPP24387 322 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CD40P25942 277 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TUBA1BP68363 451 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TUBA4AP68366 448 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 MVKQ03426 396 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC58Q4VC31 144 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 RNLSQ5VYX0 342 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TUBA1AQ71U36 451 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 COMMD2Q86X83 199 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 OR52N1Q8NH53 320 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ST7LQ8TDW4 575 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 THRSPQ92748 146 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 GGHQ92820 318 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF799Q96GE5 643 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 PGAM5Q96HS1 289 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 C4orf45Q96LM5 186 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 RGCCQ9H4X1 137 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 NEK6Q9HC98 313 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.48□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 A0A087WXM4 84 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM129A0AVI4 362 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 H3BSA7 217 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 J3QLW9 94 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ABCD4O14678 606 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 SYNGR3O43761 229 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ATE1O95260 518 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 LCATP04180 440 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 LCKP06239 509 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 HTR1AP08908 422 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CECR9P0C854 216 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF19P17023 458 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 OPRL1P41146 370 aa8.47□□□□□ -1.05
CTPS1-210ENST00000486889 CX3CR1P49238 355 aa8.47□□□□□ -1.05
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