RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	SOX14	O95416	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RAB36	O95755	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CST1	P01037	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	NGF	P01138	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TACSTD2	P09758	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CD79A	P11912	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KITLG	P21583	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	STOM	P27105	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	IL2RG	P31785	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	MPV17	P39210	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RAD52	P43351	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A1	P53007	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	DSCR9	P59020	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	NPRL3	Q12980	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	AQP6	Q13520	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RIN1	Q13671	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	NSMAF	Q92636	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	AMELY	Q99218	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	REEP1	Q9H902	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792		H3BS24	57 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792		H7C1Q1	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SOCS2	O14508	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FCN3	O75636	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RP2	O75695	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CLPTM1	O96005	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	HEXA	P06865	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CD55	P08174	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ADRA2A	P08913	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	DBH	P09172	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CSF3	P09919	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	OSM	P13725	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ANXA8	P13928	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SLC2A5	P22732	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	GRK5	P34947	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CENPA	P49450	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	DAP	P51397	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ACTR3	P61158	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	CBX1	P83916	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	GLO1	Q04760	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PLP2	Q04941	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	RAB35	Q15286	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	SGCA	Q16586	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792		Q6ZR03	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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