RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRC42Q9Y546 428 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CASKO14936 926 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 RER1O15258 196 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV1-44P01699 117 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 SBK2P0C263 348 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CRYGSP22914 178 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF83P51522 516 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 NUDT6P53370 316 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CSNK2BP67870 215 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF91Q05481 1191 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 RAB39AQ14964 217 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF774Q6NX45 483 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 OTOSQ8NHW6 89 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 LGALS12Q96DT0 336 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CNBD2Q96M20 576 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 MNTQ99583 582 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 C1orf198Q9H425 327 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 NGBQ9NPG2 151 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ARID1AO14497 2285 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 OR6C6A6NF89 314 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 DPRXA6NFQ7 191 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 J3QRE1 110 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 M0R1B8 84 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 SGCEO43556 437 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 SYNGR3O43761 229 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 PTHP01270 115 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 SERPINA5P05154 406 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CELA3BP08861 270 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 OR2T7P0C7T2 308 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 COX5BP10606 129 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ALOX5APP20292 161 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP6V1E1P36543 226 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC15A1P46059 708 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 HCCSP53701 268 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CXCR4P61073 352 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 PLP2Q04941 152 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 RAB40BQ12829 278 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 RAB35Q15286 201 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 KLHL22Q53GT1 634 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 OR2T27Q8NH04 317 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ST7LQ8TDW4 575 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 MAP6Q96JE9 813 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ABHD6Q9BV23 337 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 COPS3Q9UNS2 423 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CR1P17927 2039 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 IRGMA1A4Y4 181 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 DOK2O60496 412 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 APOL3O95236 402 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 LYNP07948 512 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CECR9P0C854 216 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 CD40P25942 277 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 STOMP27105 288 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 ECH1Q13011 328 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 MED21Q13503 144 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-207ENST00000471650 BEX5Q5H9J7 111 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms