RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RBP7	Q96R05	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GPA33	Q99795	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		H7C1C5	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR10H3	O60404	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RP2	O75695	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NCR1	O76036	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	JTB	O76095	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DIRAS1	O95057	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NDUFB2	O95178	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NDUFA7	O95182	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GADD45G	O95257	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FAM107A	O95990	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HSD17B1	P14061	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ANPEP	P15144	967 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MAK	P20794	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MSR1	P21757	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ACHE	P22303	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CALB2	P22676	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PCBD1	P61457	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LCN6	P62502	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ERVK-25	P63136	954 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PRKCD	Q05655	676 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DGCR6	Q14129	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RDH5	Q92781	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PYURF	Q96I23	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		A0A087WUU8	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		B2RBV5	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SOCS2	O14508	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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