RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF649Q9BS31 505 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SP140LQ9H930 580 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 GNG8Q9UK08 70 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 J3QLW9 94 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMD9O00233 223 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 CASKO14936 926 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV1-44P01699 117 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 HTR1AP08908 422 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF19P17023 458 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF83P51522 516 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH15P55291 814 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT4P56705 351 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 GALK2Q01415 458 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53I3Q53FA7 332 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF544Q6NX49 715 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL9Q6T311 187 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATC1Q76KD6 591 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SPARTQ8N0X7 666 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 FCGR1BQ92637 280 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 C4orf36Q96KX1 117 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF75AQ96N20 296 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH20Q9HBT6 801 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 NOX3Q9HBY0 568 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 LRP12Q9Y561 859 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 C5orf49A4QMS7 147 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOD1A6NK06 481 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR32B1ATL7 298 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 F5H5K5 113 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R135 149 aa8.16□□□□□ -1.1
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SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD16AO95870 558 aa8.16□□□□□ -1.1
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SH3BP4-208ENST00000462602 CRYGSP22914 178 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 PTAFRP25105 342 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DL3P43628 341 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS6P49758 472 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP16P51512 607 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKXP51817 358 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 OR12D2P58182 307 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TAS2R43P59537 309 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 SPHARQ15513 63 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 LIPNQ5VXI9 398 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 DRAM2Q6UX65 266 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01560Q8TB33 94 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM222BQ8WU58 562 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF799Q96GE5 643 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 R4GMQ9 66 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.15□□□□□ -1.1
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