RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SLC35E2P0CK97 266 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 LIM2P55344 173 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 SYT13Q7L8C5 426 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 MARCH1Q8TCQ1 289 aa13.21□□□□□ -0.3
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
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PTPRU-204ENST00000428026 C1orf53Q5VUE5 145 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 OR5AP2Q8NGF4 316 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 OR4C16Q8NGL9 310 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRU-204ENST00000428026 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.19□□□□□ -0.3
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