RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAET1LQ5VY80 246 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NKAIN3Q8N8D7 197 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF878C9JN71 531 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKR7A2O43488 359 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZIC3O60481 467 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAF2O60831 178 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHEP01854 428 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HPXP02790 462 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 QDPRP09417 244 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SULT1A3P0DMM9 295 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SULT1A4P0DMN0 295 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYPD6Q86Y78 171 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JAGN1Q8N5M9 183 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOX3Q9HBY0 568 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DKKL1Q9UK85 242 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2M5A3KFT3 312 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSNA1O43805 119 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGM6O95932 706 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF883P0CG24 379 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MPLP40238 635 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN17P56750 224 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GUCA2AQ02747 115 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf100Q5SVJ3 147 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DBX2Q6ZNG2 339 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGGYQ96C11 551 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.6■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GUH1 482 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYT7O43581 403 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSF1P09603 554 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABRA1P14867 456 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNMB1Q16558 191 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PADI1Q9ULC6 663 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ING4Q9UNL4 249 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPB11Q9Y547 144 aa16.59■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LDLRAD4O15165 306 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFB6O95139 128 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSD11B1P28845 292 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS3P35030 304 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABREP78334 506 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LUZP2Q86TE4 346 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOB1AQ9H8S9 216 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP64Q9NPA5 681 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCFL5Q9UL49 500 aa16.58■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEIKINA0A087WXM9 373 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ICMTO60725 284 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALX3O95076 343 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTX2P32243 289 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF813Q6ZN06 617 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM41AQ96HV5 264 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.58■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RER1O15258 196 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD63P08962 238 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF17P17021 662 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BDKRB2P30411 391 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNALP38405 381 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN6P56747 220 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZP1P60852 638 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1J2Q8NGS2 313 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GTI1 187 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEIS3P1A6NDR6 274 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBR3O75828 277 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR2C1P13056 603 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCN2P20062 427 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD52P43351 418 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms