RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 SELENOTP62341 195 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 EGR3Q06889 387 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CCL15Q16663 113 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 C1orf159Q96HA4 380 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SEC22AQ96IW7 307 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 VAX2Q9UIW0 290 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 DKKL1Q9UK85 242 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 AGPAT2O15120 278 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SLC16A5O15375 505 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CH25HO95992 272 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CST4P01036 141 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 TGFAP01135 160 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 RPN2P04844 631 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 OR8U9P0C7N5 309 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 FOLR1P15328 257 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZBTB25P24278 435 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CCKARP32238 428 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 PRSS3P35030 304 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CSNK1DP48730 415 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 PDX1P52945 283 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 FAM3AP98173 230 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 NOGQ13253 232 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 BIVMQ86UB2 503 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 GKN2Q86XP6 184 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 OR8U1Q8NH10 309 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SFXN5Q8TD22 340 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 Q8WTZ3 238 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 LIPHQ8WWY8 451 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ARSGQ96EG1 525 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 TBX5Q99593 518 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 NELFAQ9H3P2 528 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 RRAGCQ9HB90 399 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 MYNNQ9NPC7 610 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 NGBQ9NPG2 151 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 GLOD5A6NK44 160 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF716A6NP11 495 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 JTBO76095 146 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 GPANK1O95872 356 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 TRGC2P03986 189 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CD3DP04234 171 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF735P0CB33 412 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 CXCR1P25024 350 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 BRS3P32247 399 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 APLNRP35414 380 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 OR12D2P58182 307 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 PAX5Q02548 391 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF85Q03923 595 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ST3GAL3Q11203 375 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 SYT9Q86SS6 491 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00501-201ENST00000425388 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms