RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C74A6NCV1 312 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC31A1O15431 190 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CSTAP01040 98 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IL11P20809 199 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NTSR1P30989 418 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXK1P85037 733 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FMODQ06828 376 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNMB1Q16558 191 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB110Q30KQ9 67 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF550Q7Z398 422 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 POC1AQ8NBT0 407 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52N5Q8NH56 324 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP10Q96PS8 301 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LAT2Q9GZY6 243 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 UCK1Q9HA47 277 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KALRNO60229 2985 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5H14A6NHG9 310 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GNB5O14775 395 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TACR3P29371 465 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS3P35030 304 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LEG1Q6P5S2 330 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF563Q8TA94 476 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CMBLQ96DG6 245 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD2Q9UBB5 411 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ATMQ13315 3056 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FLNCQ14315 2725 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CADP27708 2225 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM82A0PJX8 343 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF726A6NNF4 738 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YIG0 161 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 M0QYG6 137 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF432O94892 652 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ONECUT2O95948 504 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CA3P07451 260 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RNH1P13489 461 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF708P17019 499 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCD3P28288 659 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 YPEL5P62699 121 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HTRA3P83110 453 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOCQ15369 112 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ELP2Q6IA86 826 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGKQ92643 395 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10C1Q96KK4 312 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NICN1Q9BSH3 213 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DPP7Q9UHL4 492 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA1O95477 2261 aa3.21□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SSNA1O43805 119 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNGP01579 166 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CTNNB1P35222 781 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RFC3P40938 356 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG10Q5BKT4 473 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GLYATL3Q5SZD4 288 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RHBDD1Q8TEB9 315 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB33BQ9H082 229 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JNG1 304 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DS3K7RE56 304 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF2O60811 474 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PNMTP11086 282 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CD1CP29017 333 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GDI1P31150 447 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LPAR6P43657 344 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CXADRP78310 365 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DS5Q14953 304 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 POC1BQ8TC44 478 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms