RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 FMO3P31513 532 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEB1P43366 347 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK5Q00535 292 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP1-1Q07627 177 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 PSG7Q13046 419 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF511Q8NB15 262 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 RDH5Q92781 318 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 PTP4A1Q93096 173 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 COG8Q96MW5 612 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 POFUT1Q9H488 388 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR76Q9H967 626 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM183AA6NL82 134 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGN1P05114 100 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS6P49758 472 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DAPP51397 102 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF81P51508 661 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP15P51511 669 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL8P80075 99 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ECH1Q13011 328 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GGTLC2Q14390 218 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PCGF3Q3KNV8 242 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 LYPD4Q6UWN0 246 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 OTULINQ96BN8 352 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CMBLQ96DG6 245 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP6Q96JE9 813 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 BPESC1Q9GZL8 116 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MED20Q9H944 212 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PLSCR5A0PG75 271 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 F5H5K5 113 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 G3V2T6 193 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 LIPAP38571 399 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS27P42677 84 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 BLVRAP53004 296 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RIN1Q13671 783 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM249Q2WGJ8 235 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 FAHD1Q6P587 224 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 AMIGO2Q86SJ2 522 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 HIPK1Q86Z02 1210 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5L1Q8NGL2 311 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6K6Q8NGW6 343 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC9Q8WXX5 260 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 HAVCR1Q96D42 359 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ATF6BQ99941 703 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 HCAR1Q9BXC0 346 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CYSLTR2Q9NS75 346 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF17Q9P2E2 1029 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFHX3Q15911 3703 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CSPG4Q6UVK1 2322 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 EBAG9O00559 213 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SPRY3O43610 288 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 NCR1O76036 304 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TSTQ16762 297 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01590Q5TEZ4 76 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM236Q5W0B7 351 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 LRTOMTQ8WZ04 291 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DECR2Q9NUI1 292 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 J3QW42 95 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SURF4O15260 269 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CD5LO43866 347 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ACSM4P0C7M7 580 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 FCGR1AP12314 374 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PAICSP22234 425 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ENTPD1P49961 510 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CRISP1P54107 249 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PCK2Q16822 640 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX30Q5JUR7 227 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 DCXRQ7Z4W1 244 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 NAA40Q86UY6 237 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 YIPF5Q969M3 257 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX12Q9BXU0 123 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 OR51V1Q9H2C8 321 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 CHODLQ9H9P2 273 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GLCEO94923 617 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV1-46P01743 117 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 SPARCP09486 303 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 PSKH1P11801 424 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 RAC2P15153 192 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 KITLGP21583 273 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 ACHEP22303 614 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 GSTT1P30711 240 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM33P57088 247 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP4-204ENST00000416021 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms