RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLCE1Q9P212 2302 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACANP16112 2415 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM64BA6NI03 449 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 J3QW42 95 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLPTM1O96005 669 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NGFP01138 241 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MT-ND5P03915 603 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DBHP09172 617 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSF3P09919 207 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBG1P23258 451 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSTT1P30711 240 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DSCR9P59020 149 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL12Q53G59 568 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX30Q5JUR7 227 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPOQ8IVL8 374 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP6Q96JE9 813 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INTS14Q96SY0 518 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TPK1Q9H3S4 243 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.89□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USF3Q68DE3 2245 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZAR1LA6NP61 321 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H7C1Q1 480 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LY6HO94772 140 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHV3-13P01766 116 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOSL1P15407 271 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNK1Q13470 666 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZSCAN26Q16670 478 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCK2Q16822 640 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF525Q8N782 197 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C18orf12Q96KH6 178 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DLL4Q9NR61 685 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.88□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F5H5K5 113 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EI24O14681 340 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPHA2P29317 976 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPV17P39210 176 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM168AQ92567 244 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPTSSAQ969W0 71 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MARCH7Q9H992 704 aa14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLSCR5A0PG75 271 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF878C9JN71 531 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKYO43930 277 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAT2P11245 290 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSKH1P11801 424 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH3A2P51648 485 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TPTEP56180 551 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAF13Q15543 124 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C12orf73Q69YU5 71 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHFQ7M4L6 423 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIGD4Q8IY51 512 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COPS4Q9BT78 406 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USE1Q9NZ43 259 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STARD10Q9Y365 291 aa14.86□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS13CQ709C8 3753 aa14.85□□□□□ -0.03
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 M0R135 149 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms