RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PRELID1	Q9Y255	219 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879		M0R036	132 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SH2D1B	O14796	132 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	GUSB	P08236	651 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	GALNT16	Q8N428	558 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	FOXB1	Q99853	325 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	HINT2	Q9BX68	163 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879		R4GN57	208 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879		B8ZZF3	427 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	TNFSF11	O14788	317 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	KLK10	O43240	276 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	NRAS	P01111	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	CD163	Q86VB7	1156 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SYT9	Q86SS6	491 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MLX	Q9UH92	298 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	TOX	O94900	526 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	FUT6	P51993	359 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	NUBP1	P53384	320 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	RAC3	P60763	192 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PCK2	Q16822	640 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	LGI3	Q8N145	548 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	DDA1	Q9BW61	102 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MMP28	Q9H239	520 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	IFITM5	A6NNB3	132 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ASAH1	Q13510	395 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	AMER3	Q8N944	861 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	CT55	Q8WUE5	264 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MED29	Q9NX70	200 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	TCRB	P04435	133 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879		Q7L0L9	218 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	NCR1	O76036	304 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	IGLV3-19	P01714	112 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	FOXC1	Q12948	553 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PRR18	Q8N4B5	295 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	GPR119	Q8TDV5	335 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF17	P17021	662 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	AVPR2	P30518	371 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	PTGER4	P35408	488 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MEOX1	P50221	254 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	HBG1	P69891	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	HBG2	P69892	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	ACSM1	Q08AH1	577 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	MDGA2	Q7Z553	956 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPRF-205	ENST00000414879	OR6X1	Q8NH79	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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